A segunda etapa do Ensino Fundamental é marcada pelo aprofundamento e ampliação dos conhecimentos adquiridos na primeira fase. A primeira grande mudança neste momento é o fim do professor polivalente: agora, cada disciplina é ministrada por um professor especialista. Cada um trazendo a linguagem de sua ciência para a leitura e interpretação do mundo físico e social. Para isso, são trabalhadas questões que refletem no bom desempenho de toda a vida estudantil: organização dos materiais, preparação e cumprimento da agenda de compromissos, lição de casa, organização do estudo, etc. O objetivo é atingir um aprimoramento gradual de sua autonomia nos estudos e prepará-lo para o Ensino Médio.